MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae FA 1090 chromosome

Total Repeats: 9622

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002946	ATATT	2	10	106	115	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002946	GCG	2	6	3001	3006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002946	GTT	3	9	5123	5131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002946	GCGG	2	8	5140	5147	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_002946	GGC	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002946	GGC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_002946	TGACG	2	10	5197	5206	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_002946	GAT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002946	CGGCT	2	10	5777	5786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_002946	GCGG	2	8	5793	5800	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_002946	GTA	2	6	5889	5894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002946	GTGGAA	2	12	5945	5956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002946	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_002946	GCGG	2	8	6001	6008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_002946	GTC	2	6	6026	6031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002946	TTG	2	6	6090	6095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002946	GTCG	2	8	6134	6141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_002946	GCAG	2	8	6174	6181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_002946	TGCC	2	8	6188	6195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_002946	TTTG	2	8	6224	6231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002946	T	6	6	6251	6256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002946	A	6	6	6340	6345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002946	ATG	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002946	TCC	2	6	6460	6465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_002946	AGAC	2	8	9232	9239	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_002946	CTG	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002946	CTA	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_002946	GAA	2	6	10311	10316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002946	A	6	6	10341	10346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002946	GAC	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002946	ATTAT	2	10	11558	11567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002946	GGT	2	6	11609	11614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002946	AATA	2	8	11642	11649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002946	GTC	2	6	11676	11681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002946	GAC	2	6	11696	11701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_002946	CCG	2	6	11715	11720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002946	GCA	2	6	11796	11801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002946	ATT	2	6	11812	11817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002946	ATGCTG	2	12	11914	11925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_002946	GTT	2	6	11957	11962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002946	TAA	2	6	12014	12019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002946	A	6	6	12018	12023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002946	AAGGG	2	10	12034	12043	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002946	GTT	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002946	CGG	2	6	12336	12341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002946	GGCA	2	8	12355	12362	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_002946	CAG	2	6	12367	12372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002946	GAT	2	6	12794	12799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002946	GGC	2	6	12800	12805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002946	CCG	2	6	12921	12926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_002946	CCTTGC	2	12	12933	12944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002946	GCT	2	6	12955	12960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_002946	CGC	2	6	12969	12974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_002946	CTT	2	6	13048	13053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002946	GCC	2	6	13151	13156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_002946	GCC	2	6	13186	13191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_002946	CGG	2	6	13200	13205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002946	ATT	2	6	13214	13219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002946	T	6	6	13218	13223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002946	AATC	2	8	13224	13231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_002946	AACC	2	8	13294	13301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_002946	T	6	6	13655	13660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002946	A	7	7	13671	13677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002946	TGG	2	6	13766	13771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002946	A	6	6	13811	13816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_002946	ATTG	2	8	13903	13910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002946	A	8	8	13944	13951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002946	TG	3	6	13975	13980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002946	T	6	6	15213	15218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002946	CGTGT	2	10	15223	15232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002946	TCTG	2	8	15236	15243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_002946	GCG	2	6	15283	15288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002946	GCGG	2	8	15304	15311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
74	NC_002946	TGT	2	6	15331	15336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002946	CGGG	2	8	15909	15916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_002946	GCG	2	6	15937	15942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_002946	TGCC	2	8	15960	15967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_002946	ATT	2	6	15980	15985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002946	T	7	7	16717	16723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002946	G	6	6	16725	16730	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002946	GGC	2	6	17062	17067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002946	GTC	2	6	17115	17120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002946	GGC	2	6	17238	17243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002946	GGC	2	6	17262	17267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002946	GCT	2	6	17283	17288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002946	GAC	2	6	17316	17321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_002946	TG	3	6	19512	19517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002946	GCCCC	2	10	19570	19579	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
89	NC_002946	CTGC	2	8	19645	19652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002946	CGC	2	6	19657	19662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_002946	GCT	2	6	19715	19720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002946	CTTC	2	8	19742	19749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_002946	GTTT	2	8	20102	20109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002946	ATT	2	6	21268	21273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002946	TAA	2	6	21276	21281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002946	TTTGA	2	10	22303	22312	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002946	AAC	2	6	22313	22318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002946	A	6	6	22323	22328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002946	T	6	6	22359	22364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002946	CGG	2	6	22371	22376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002946	GGC	2	6	24474	24479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002946	GCG	2	6	24486	24491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002946	GT	4	8	26254	26261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002946	GGT	2	6	26287	26292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002946	GCG	2	6	27002	27007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002946	TA	3	6	28887	28892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002946	TGCC	2	8	28905	28912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_002946	GTC	2	6	28915	28920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002946	ATA	2	6	29865	29870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002946	TA	3	6	29869	29874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002946	T	7	7	29895	29901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002946	T	6	6	31100	31105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002946	A	6	6	31111	31116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002946	CGG	2	6	31152	31157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002946	GT	3	6	31194	31199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002946	T	6	6	31224	31229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002946	TG	3	6	31236	31241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002946	AT	3	6	32204	32209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002946	GAC	2	6	32228	32233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002946	A	6	6	32238	32243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002946	AC	3	6	32245	32250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_002946	CGT	2	6	34181	34186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002946	GCG	2	6	34193	34198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_002946	GTTT	2	8	34211	34218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002946	T	7	7	34225	34231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002946	GGC	2	6	34246	34251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002946	GCG	2	6	34265	34270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_002946	CGG	3	9	34334	34342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_002946	GGC	2	6	34387	34392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_002946	GTT	2	6	35783	35788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002946	A	6	6	35795	35800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002946	ACG	2	6	35812	35817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002946	TCGG	2	8	35897	35904	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_002946	GT	3	6	35937	35942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002946	TGC	2	6	35968	35973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002946	TG	3	6	35974	35979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002946	TCG	2	6	36094	36099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_002946	TTTG	2	8	37835	37842	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002946	CCG	2	6	37866	37871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_002946	AT	3	6	38020	38025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002946	AGT	2	6	38050	38055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002946	CCG	2	6	38186	38191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_002946	AAT	2	6	38235	38240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002946	A	6	6	38292	38297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002946	GGC	2	6	38447	38452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_002946	CCGG	2	8	38500	38507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_002946	AAT	2	6	38516	38521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002946	GCG	2	6	38554	38559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_002946	CGG	2	6	38605	38610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_002946	GGC	2	6	38702	38707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_002946	GGC	2	6	42946	42951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_002946	CT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_002946	GA	3	6	48543	48548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_002946	GCCG	2	8	57064	57071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_002946	TG	3	6	58204	58209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_002946	T	6	6	58275	58280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_002946	A	7	7	85550	85556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_002946	CCT	2	6	85559	85564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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